1. 研究目的与意义
内容：本课题运用分子对接和分子动力学技术研究板蓝根中潜在的抑制流感病毒神经氨酸酶的抑制剂，从而为板蓝根抗病毒物质基础提供解释。
通过文献查找，搜寻板蓝根中已鉴定出的生物碱部分的化学结构，从蛋白质数据库中获取流感病毒神经氨酸酶的三维结构，利用Autodock分子对接软件筛选潜在的和神经氨酸酶作用较强的分子，并利用Amber分子动力学软件对筛选出的分子和神经氨酸酶复合物分子进行动力学模拟计算，评估小分子和蛋白质分子的结合稳定性。
意义：通过分子对接和分子动力学模拟，我们可以筛选出板蓝根中抗流感病毒神经氨酸酶的潜在活跃成分，可为板蓝根抗流感病毒的物质基础提供解释，也可为中药先导化合物的发现和新型药物分子的设计提供指导。
2. 文献综述
流感病毒神经氨酸酶抑制剂的研究进展摘要：流行性感冒是流感病毒引起的一种呼吸道传染病，传播性强，流感病毒上的神经氨酸酶病毒的传染有重要作用，是人们研究抗病毒药物的重要靶点。
目前临床使用的神经氨酸酶抑制剂主要是扎那米韦和奥司他韦，中药在我国有着悠久的治疗伤寒的历史，许多中药中都含有抑制神经氨酸的成分。
本文综述了近期神经氨酸酶抑制剂的研究状况以及中药在神经氨酸酶抑制作用方面的部分研究成果。
3. 设计方案和技术路线
研究方案（1）从文献中获取板蓝根中生物碱成分的结构，建立板蓝根分子的三维结构并进行优化获得其稳定构象。
（2）从蛋白质数据库中获取流感病毒神经氨酸酶的三维结构，利用Autodock将小分子和神经氨酸酶进行对接，筛选出作用较强的小分子。
（3）利用Amber对小分子和神经氨酸酶的复合物进行动力学模拟计算，评估结构稳定性和结合自由能。
4. 工作计划
2022.012022.02查阅文献，熟悉软件使用，构建生物碱分子三维结构2022.032022.05进行分子对接和分子动力学模拟2022.06整理数据，完成论文
5. 难点与创新点
目前，板蓝根抗流感病毒的机理并不很明确，尚未有利用分子对接和分子动力学对板蓝根进行流感病毒神经氨酸酶抑制剂的筛选研究，所以本文将分子动力学和分子对接结合起来对板蓝根抑制流感病毒神经氨酸酶的模拟计算，筛选板蓝根抗流感病毒神经氨酸酶的活性分子以及作用模式分析，可为板蓝根及其他中药的抗病毒物质基础提供指导，也可为板蓝根中具有抗病毒作用的先导化合物的发现提供线索。
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