1. 研究目的与意义
天然裂木脂素Peperomin E(Pep E)来源于草胡椒属植物石蝉草(Peperomia dindygulensis)的地上部分,实验室前期已经从石蝉草全草中提取出纯度大于99%的peperomin E单体。
目前的体外抗肿瘤活性研究表明pep E对肺癌、乳腺癌、急性白血病细胞等细胞株有一定的抗肿瘤效果。
本课题组前期通过免疫印迹法以及流式细胞检测法,猜测pep E对胃癌细胞株SGC-7901, BGC-823, MKN-45的抗肿瘤活性是通过下调PI3K和PAkt从而诱导胃癌细胞凋亡。
2. 文献综述
全基因组甲基化水平的测定方法综述殳叶婷 13药物制剂 048013113摘 要:DNA甲基化是表观遗传学的重要机制中的一种,在胚胎发育、基因表达调控、基因组印迹、X染色体失活等方面起着重要作用,与肿瘤的发生密切相关。
本文对甲基化的定义和全基因组甲基化的测定方法进行了综述。
通过查阅国内外文献期刊,解释了DNA甲基化是什么,与肿瘤有什么关系。
3. 设计方案和技术路线
研究方案:1. LC-MS/MS法测定不同浓度pep E对急性白血病细胞中全基因组甲基化水平的影响1) 不同给药组细胞基因组DNA提取2) 提取的基因组DNA水解成核苷酸3) LC-MS/MS测定5mdC、dG含量4) 计算全基因组甲基化水平(%)=5mdC/dG*100%2. Western Blotting法测定不同浓度pep E对急性白血病细胞中DNMT表达的影响1) 细胞全蛋白提取2) WB法检测蛋白相对内参的表达量3. Methylated-Specific PCR法检测不同浓度pep E对急性白血病细胞中抑癌基因表达的影响1) 基因组DNA提取2) 亚硫酸盐处理基因组DNA3) MSP法检测甲基化基因与未甲基化基因的比值技术路线:
4. 工作计划
2022年1 ~2月文献查阅,学习细胞培养、进行预实验2022年3月 LC-MS/MS法测定不同浓度pep E对急性白血病细胞中全基因组甲基化水平的影响2022年4月 Western Blotting法测定不同浓度pep E对急性白血病细胞中DNMT表达的影响2022年5月 Methylated-Specific PCR法检测不同浓度pep E对急性白血病细胞中抑癌基因表达的影响2022年6月 整理数据,撰写论文,毕业答辩
5. 难点与创新点
首次对天然裂木脂素peperomin E进行抗急性白血病的机制进行探索
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