长江刀鲚DnaJa1和DnaJb1基因的克隆与表达分析开题报告

 2023-02-16 09:30:24

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

刀鲚 (Coilia nasus) 为近岸溯河性小型经济鱼类,一般栖息于海洋和近岸。

在我国长江流域,刀鲚是长江三鲜之首,其肉质细嫩鲜美,富含脂肪,具有很高的经济价值。

历史记录长江洄游生态型刀鲚资源量极其丰富,但由于过度捕捞,生境破坏、水体污染及早期资源受损等方面的影响导致刀鲚资源量近些年来锐减。

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2. 研究的基本内容和问题

研究目标:本研究克隆了刀鲚DnaJ及其同源基因家族的若干成员基因 , 并采用实时荧光定量PCR技术对这些基因在刀鲚不同发育时期和不同组织中的表达情况进行了研究 , 为进一步探讨 DnaJ及其同源基因的功能奠定基础。

研究内容: 将从长江水域采样获得的刀鲚参照试剂盒选取肝脏、性腺、脑等组织提取各组织器官总RNA组,并利用刀鲚不同组织器官的总RNA反转录合成cDNA第一链、从刀鲚cDNA文库中检索到的一条DnaJ蛋白的EST作为信息探针,用tBLASTN程序检索刀鲚EST库,获得同源性较高的序列并用DNAStar进行电子延伸,获得基因重叠群。

再以各个组织的cDNA 为模板进行反转录荧光定量PCR,分析基因在刀鲚不同组织器官的转录水平。

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3. 研究的方法与方案

研究方法:将项目进行模块化研究,将项目分成几个小的部分,再将小块项目逐步完成,最后统一进行合并。

并积极与指导老师交流沟通,确定正确的研究思路,明确目前研究的不足之处,通过各种途径学习与本研究相关的知识以解决研究过程中将遇到的问题。

拟定具体的研究方案,并打印成表,以便严格按照计划实验。

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4. 研究创新点

对DnaJ基因家族的研究尚处于初始段,而对长江刀鲚的DnaJ及其同源基因的研究更是尚未见报道。

因此,对长江刀鲚的DnaJ及其同源基因测序,并采用实时荧光定量PCR技术对DnaJ及其同源基因在刀鲚不同发育时期和不同组织中的表达情况进行了研究、分析,是一项全新的尝试与挑战,不仅将扩宽对刀鲚基因层面的认识,为刀鲚的人工繁殖与研究提供科学数据;也将为进一步探讨 DnaJ及其同源基因的结构与功能奠定基础。

5. 研究计划与进展

1)2017年10月-12月与指导老师交流沟通,确定正确的研究思路,明确目前研究的不足之处,通过各种途径学习与本研究相关的知识以解决研究过程中将遇到的问题。

拟定具体的研究方案,并打印成表,以便严格按照计划实验。

向老师请教并确定研究过程中所需的材料和相应的仪器设备,并且通过实验课及书本熟悉仪器的原理和基本操作方法,为研究做好充足准备。

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