利用微卫星标记分析2个吉富罗非鱼群体的遗传多样性开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

【意义】罗非鱼属鲈形目（Perciformes）丽鱼科（Cichidae）罗非鱼属，是联合国粮农组织向全球推广的淡水经济鱼类，具有生长速度快、繁殖力强、抗病力强、食性杂等优点，其养殖遍布多个国家和地区。罗非鱼养殖在我国淡水养殖业中占有非常重要的地位，其产量占世界罗非鱼年产量的一半以上。但由于存在性成熟早、繁殖周期短，易发生种间杂交导致种质退化和混杂等问题，严重影响了其养殖经济效益。因此，对罗非鱼群体进行检测和遗传分析，揭示不同罗非鱼群体的遗传多样性及种间遗传差异，对罗非鱼良种培育和分子标记辅助育种具有重要意义。【研究概况】吉富品系尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）简称吉富罗非鱼，是用4个非洲原产地直接引进的尼罗罗非鱼品系（埃及、加纳、肯尼亚、塞内加尔）和4个亚洲养殖品系（以色列、新加坡、泰国、中国台湾），经混合选育获得的优良品系。与我国目前养殖的尼罗罗非鱼各品系相比，吉富罗非鱼生长速度比其他品系快5%~30%，单位面积产量提高20%~30%，养殖成本降低20%~30%。。李莉好等（2007）利用AFLP技术对吉富罗非鱼不同选育群体的遗传多样性进行研究，发现青岛吉富鱼的多态位点比例（48.4%）和基因多样性（0.245）最高，海南吉富鱼的多态位点比例（36.3%）和基因多样性（0.147）最低，即青岛吉富鱼的遗传多样性最高、海南吉富鱼最低；而AMOVA分析显示，大部分遗传变异（微卫星的分析结果为91.26%，而AFLP的为67.6%）来源于群体内个体间，说明吉富鱼选育品系尚具有进一步选育的潜力。。陈文华等（2009）

对5个家系吉富罗非鱼的遗传多样性分析结果表明，22家系、25家系、59家系、49家系、31家系均为中度多态性，家系间基因分化系数（GST）为0.1676，各家系间存在一定遗传分化；根据遗传距离采用UPGMA法对5个家系进行聚类，发现49家系和59家系遗传距离最小聚为一类，与31家系遗传距离最远。【应用前景】本研究以2个两个吉富罗非鱼群体为实验材料，用微卫星标记技术分析这2个罗非鱼群体的遗传多样性，为吉富罗非鱼选育过程中育种计划的制定提供可靠的背景资料, 并为吉富罗非鱼养殖群体的遗传改良提供依据。

参考文献：

2. 研究的基本内容和问题

以2个吉富罗非鱼群体为实验材料，应用微卫星标记技术对实验鱼DNA基因组进行PCR扩增，分析2个群体的遗传多样性，并寻找可以鉴别2个吉富罗非鱼群体的分子标记，为吉富罗非鱼种质资源的保护、评价以及进一步选育提供遗传背景资料，同时丰富吉富罗非鱼分子标记辅助育种的基础数据。

3. 研究的方法与方案

微卫星分子标记技术由于具有在基因组中分布广泛、多态性丰富、易于检测、进化所受选择压力小等特点,在度量遗传多样性及构建系统发生树等研究中显示出巨大的优势, 被认为是各类遗传标记中最有价值的一种。被广泛用于群体遗传分析、品种及亲子鉴别等研究。本课题将通过微卫星标记技术对2个吉富罗非鱼群体进行检测和分析，得出它们的遗传多样性。

技术路线如下：

从2个吉富罗非鱼群体随机选取30尾采样

4. 研究创新点

利用微卫星标记对不同2个吉富罗非鱼群体进行遗传多样性分析，了解2个吉富罗非鱼群体的遗传背景和亲缘关系，寻找鉴别2个吉富罗非鱼群体品种的分子标记，有助于我国吉富罗非鱼群体的种质资源保护和合理利用。

5. 研究计划与进展

2013年10月-2014年4月：查阅资料，采样，进行实验。

2014年5月-2014年6月：分析和总结实验结果，撰写论文。

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