1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
本课题的意义
鲤是我国种类繁多、分布广泛、深受人们欢迎的重要淡水经济鱼类。对鲤鱼进行基础研究,发展鲤鱼鉴定系统,进行遗传改良和杂交育种是提高鲤产业发展的重要支撑。DNA条码技术自出现以来,非常迅速地通过线粒体基因比对的方式用于种质鉴定,而在鲤鱼上还没有明确的研究,因此,需要通过DNA条码技术来对鲤鱼种质进行鉴定。
国内外研究概况
2. 研究的基本内容和问题
研究的目的
1,研究不同鲤鱼的COI, COII, Cytb, D-loop 四条线粒体基因序列的饱和性分析DNA条码技术可能性,四条线粒体基因序列的多序列对比,NJ树状图和变异区统计tag方法对鲤鱼种质鉴定的可能性。
2,研究分析不同种的鲤鱼,不同国家的鲤鱼能否利用DNA条码技术进行鉴定,分析COI, COII, Cytb, D-loop 四条线粒体基因序列遗传间距,变异区,A、T、C、G核苷酸频率等确定它们对鲤鱼种质鉴定的效果。
3. 研究的方法与方案
研究方法及方案
1,数据收集
用DANMAN在NCBI上收集COI, COII, Cytb, D-loop 四条线粒体基因序列,序列长度,生物体分类情况,时间,相关杂志,生物体的所在地,GenBank位置,并对序列进行筛选COI (658bp),COII (655bp),Cytb(535bp), D-LOOP (683bp),短于其的数据进行删除。
4. 研究创新点
特色或创新之处
1,首次利用DNA条码技术对鲤鱼进行种质鉴定,评价COI, COII, Cytb, D-loop 四条线粒体基因序列对鲤鱼进行种质鉴定效果。
2,通过线粒体对齐的方式快速廉价地对鲤鱼物种探索。
5. 研究计划与进展
研究计划及预期进展
1,2013年6月收集相关文献进行研读,下载相关软件研究;
2,2013年7月到8月到NCBI上收集需要的COI, COII, Cytb, D-loop 四条线粒体基因;
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