1. 研究目的与意义
研究背景
鲀类隶属于鲀形目(Tetrodontiformes),种类繁多,有2亚目(鳞鲀亚目Balistodei和鲀亚目Tetraodontoidei) 6总科、11科、100属,约330余种(Tvler1980),中国产11科61属131种,各类别在中国均有相当数量的代表。鲀类主要分布于太平洋、印度洋和大西洋热带和亚热带的暖水水域,少数在温带或寒温带。
中国主要分布于南海、台湾沿海、东海以及黄、渤海。其中的许多种类是世界上重要的海洋经济鱼类,鲀类在中国渔业中占有一定地位,中国鲀形目鱼类中的主要经济鱼类为马面鲀属、绒纹线鳞鲀及东方鲀属。鲀形目鲀科鱼的肉味鲜美,蛋白质含量高,营养丰富,鲜食和加工品已大量行销国内外,深受欢迎。鲀形目不少种类为有毒鱼类,从毒性最甚的东方鲀属(TakifueuAbe1949)提取的河鲀毒素是十分昂贵的医药用品。
2. 研究内容和预期目标
本课题主要研究内容和预期目标
在核酸分子水平上对鱼类进行种质鉴定、多样性评估,并探讨它们的亲缘关系和系统演化,是目前鱼类遗传育种、资源评估和起源进化研究最有效的手段。线粒体DNA(mtDNA)因其区别于核基因组DNA的独特特点已成为了鱼类系统发育研究的可靠标记。由于线粒体中不同基因的进化速度不同,所以对于鱼类系统发育研究而言,其所具有的系统发育信息也不同。
国内外一些学者对已知分类关系的鱼类的线粒体不同蛋白质编码基因核苷酸以及氨基酸所含有的系统发育信息进行了研究后,在不同分类阶元上得出其13个蛋白编码基因含有的系统发育信息明显不同,一般分成较好、中等、较差等类别,比如,日本学者Miyabo对已知分类关系的8种硬骨鱼类的线粒体编码基因核苷酸序列分析后,得出了以下结论,非常好的一组包括ND5、ND4、COIII和COI,好的一组包括COIl和Cytb,中等的一组包括ND3和ND2,差的一组包括NDl和ATPase6,非常差的一组包括ND4L、ND6和ATPase8。但,也有一些关于13个蛋白编码基因含有的系统发育信息的研究将它们归类上存在差异。
3. 研究的方法与步骤
3.1 样品采集
鲀目鱼类样品于市场中进行采集,取体壁肌肉,置于体积分数 75%酒精中,于冰箱(4 ℃)保存。
4. 参考文献
[1] 刘丽,刘楚吾,张明辉,等.不同保存条件下鱼类组织基因组DNA的提取效果分析[J].广东海洋大学学报,2007, 27(6):19-22.
[2] 肖武汉,张亚平.鱼类线粒体DNA的遗传与进化[J].水生生物学报,2000, 24(4): 228-236.
[3] 郭新红,刘少军,刘巧,等.鱼类线粒体DNA研究新进展[J].遗传学报,2004 , 31(9) : 983- 1000.
5. 计划与进度安排
(1)2024年第一学期第1周,接受任务书,查阅资料,确定所选基因,准备开题报告,外文论文翻译。
(2)第2周-第4周综合相关文献资料,撰写开题报告,原材料制备,完成实验前准备工作,配制各实验所需药品;学习提取鱼的基因组DNA和扩增线粒体Cytb基因序列。学会使用PCR仪,对PCR反应体系,循环参数进行摸索和调整等措施,学会制胶,学习制备感受态细胞,PCR目的基因。
(3)第5周-第12周完成PCR扩增产物的鉴定与割胶回收,回收纯化产物与载体连接,转化到感受态细胞中,利用白斑筛选阳性克隆,用质粒DNA小量试剂盒提取质粒,用双酶切鉴定阳性菌落,阳性菌落质粒DNA送到生物公司进行测序。
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