1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
课题意义:OIE将RVF列为必须报告的疫病,由于RVFV可以通过感染人或者动物对当地经济和公共卫生安全产生巨大的影响,并且有迅速跨境传播的可能性,需要采取措施对其进行防控[1]。
RVFV是布尼亚病毒科、白蛉热病毒属的病毒。它是一种分节段的RNA病毒,由三个RNA片段组成,分别为L,M和S节段。L片段编码病毒聚合酶蛋白,M片段编码糖蛋白Gc和Gn以及非结构蛋白NSm,L和M节段都是反义编码的RNA片段,而S节段则是采取的双义编码,反义编码核蛋白(N),正义编码非结构蛋白NSs[2]。RVFV感染细胞是通过受体介导的内吞作用,随后PH介导的病毒内体膜融合释放核衣壳进入细胞质,然后在细胞质中进行转录,翻译和基因组的复制[3]。
RVFV可以感染多种脊椎动物,在非洲的许多野生动物身上都发现RVFV感染,但致病性不强。RVFV对驯养的反刍动物致病性极强,尤其是幼龄反刍动物,如小山羊、小绵羊以及小牛[4]。人对RVFV普遍易感,大多不严重,表现为发热伴随着非典型的流感症状,一段时间后可以恢复。但有时候也会有严重的临床症状,包括眼部并发症、肝病和神经疾病[3]。RVFV主要通过蚊子传播,在许多种类蚊子中都分离出了RVFV。伊蚊、库蚊和按蚊是最主要的病毒传播媒介[5]。人可以通过被蚊子叮咬感染RVFV,但主要是通过在接触感染动物或者动物尸体的时候黏膜暴露或者吸入病毒粒子而感染[3]。裂谷热一般呈现一过性流行或呈现地方流行性,一般在高降雨量的雨林地带,该病呈现地方流行性,而一过性流行多发生于洪水或大量降雨之后。
2. 研究的基本内容和问题
研究目标:查找在南非地区分离出的毒株的基因序列,将这些序列通过软件进行对比分析,监测RVFV的基因的变异趋势,对研究其在在南非的流行情况以及减毒活疫苗对当地裂谷热病毒基因的影响有重要的指导意义。
研究内容:登录ViPR网站下载在南非分离出的毒株基因序列,登录Genbank网站下载疫苗株Entebbe株以及74HB59株的基因序列。
运用MegAlign进行序列同源性分析,研究各毒株氨基酸和核苷酸序列的相似性。
3. 研究的方法与方案
研究方法:网络查阅南非地区毒株以及当地使用的疫苗株的基因序列,应用软件进行核苷酸和氨基酸同源性分析,绘制进化树,结合当地流行情况对其进行分析。
技术路线:
4. 研究创新点
利用前人的研究结果,对其进行进一步的归纳总结,解析病毒毒力与基因变异的联系,阐明不同毒株的流行规律,对制定防控策略和疫苗开发具有重要指导意义。
5. 研究计划与进展
4.1-4.30 广泛查阅各种资料,了解裂谷热病毒的微生物学以及流行病学知识,了解裂谷热疫苗的研究进展并完成文献综述。确定论文主题。
5.1-5.15 从网上获取病毒的基因序列,并用软件进行分析。
5.16-5.23 对分析结果进行归纳总结,完成论文。
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