1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
本课题的意义、国内外研究概况、应用前景等(列出主要参考文献)近年来,全国各地猪场发生腹泻疫情都比较严重,仔猪死亡率很高,包括一些管理及防疫做得较好的猪场也有发生。
有些猪场发病持续时间长达两个多月还没稳定下来,有些猪场就算稳定2~3周后,又有反复发病的情况,损失巨大。
尤其是在进入秋冬节,昼夜温差大,特别是初生和断奶仔猪容易在此季节出现腹泻症状。
2. 研究的基本内容和问题
课题研究内容: 猪病毒性腹泻分子流行性病学调查需要实现的目标: (1)分析三种病毒在不同阶段待检猪群中的感染率(2) 分析三种病毒在待检健康猪群中3种病原的感染率态 (3)分析三种病毒在猪群中的防治关键拟解决的关键问题:试剂与实验设备由江苏省检疫局兽医所老师提供
3. 研究的方法与方案
研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析本研究从2016年10月至12月以来对江苏省进行了样品采集,并利用RT-PCR方法检测,进行本次病毒性腹泻的流行病学调查实验方案:病料 调查样品主要为2016年10月2016年12月期间,来自江苏省份临床腹泻不同生长阶段猪的粪便试剂 核酸提取及扩增相关试剂:Trizol;反转录试剂盒、Taq DNA 聚合酶、10Taq Buffer、dNTPs、DL2000DNA、Marker与Loading Buffer。
BIOWEST等引物设计与合成 根据Gen bank登录的PEDV的M 基因序列(AY974335)、TGEV的N基因序列(DQ443743)和ARV 的VP7 基因序列(DQ786577)利用Primer Premier 5.0引物设计软件设计3对引物,配制为10μmol/L的浓度。
样品处理方法 粪样:取一定量的粪便加入250μL PBS,涡旋5min,然后反复冻融3次,以转速为12000r/min离心5min,取上清200μL备用;总RNA的提取 采用Trizol方法提取,具体步骤如下:取处理好的200μL样品上清液加入1mlTrizol试剂,于室温下静置5min,使核蛋白充分解离;加入0.2mL氯仿,充分剧烈振荡15s并于室温下静置2~3min;在C条件下,12000r/min离心15min离心后取上层液体500μL,加入等体积的异丙醇,轻轻混匀,室温静置10min,然后于4℃条件下,12000r/min离心10min后弃去上清;向沉淀中加入1ml75%乙醇(由无水乙醇与DEPC水配制),轻轻混匀,室温下静止5min后于4℃条件下,7600r/min离心5min后弃上清,管底沉淀即为总RNA;将RNA 样品晾干(不要彻底干燥),加入20μL DEPC水溶解(可于55~60℃促溶10min),即得到样品总RNA 模板。
4. 研究创新点
通过本次调研来给周边猪场的防疫计划进行参考,并且分析三种病毒防治的关键,是本次实验的创新,由于全国各地猪场发生腹泻疫情的严重性,不同年份流行性病学的变化,我认为对于猪病毒性腹泻分子流行性病学调查是经久不衰的,根据流行性病学调查进一步研究病毒基因流行变异特点、传染流行特点、和流行现状,可以更好地为猪流行性腹泻病的防控提供参考。
5. 研究计划与进展
进一步内容,收集资料 (15篇文章以上) 收集资料,制定总体方案,并与指导教师讨论 讨论实验流程的合理性进行实验数据分析写分析报告准备答辩
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