1. 研究目的与意义
(1)本课题研究的现状及发展趋势:
脂氧酶:
大豆脂肪氧化酶(lipoxygenase,EC1.13.11.12;简称脂氧酶,Loxs)主要存在于大豆种子中,包括 Loxl,Lox2,Lox3三种同工酶,分别受基因Lx1,Lx2,Lx3控制,大豆脂肪氧化酶是影响大豆食用品质、储藏品质和加工品质的重要抗营养因子之一。可催化分子氧加到亚麻酸和亚油酸等不饱和脂肪酸的双顺式-1,4-戊二烯任一末端(区域专一性),形成过氧化氢衍生物等挥发性物质,直接与食品中的蛋白质和氨基酸结合,产生豆腥味和苦涩味,降低食品的风味和营养价值,而且破坏了上述几种人体必需脂肪酸,限制了豆奶、豆粉等豆制品的广泛应用。
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2. 研究内容和问题
(1)基本内容:
采用软件Discovery Studio 2.5,对大豆脂氧酶与DHA,亚油酰氯,亚麻酰氯进行分子对接,以便得到脂氧酶催化底物反应的规律,更好地理解其催化机理;得到对接作用的氢键图和条带图,将对接数据进行分析比较,寻找关键氨基酸。
(2)难题:
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3. 设计方案和技术路线
(1)研究方法:运用Discovery Studio 中的半柔性对接技术。首先进行小分子准备,补全H原子,优化处理分子动力学,施加力场;接着对脂氧酶去除结晶水,添加氢原子,删除小分子配体,优化脂氧酶,使其处于合理的构象。最后收集数据并寻找关键氨基酸。
(2)具体技术路线为:1、准备小分子2、准备蛋白质1YGE3、确定活性位点4、分子对接5、分析对接结果收集数据并寻找关键氨基酸4. 研究的条件和基础
已建立对对脂氧酶的顺、顺-1,4戊二烯结构多不饱和脂肪酸及衍生物类底物进行筛选的基本方法,计算使用Discovery studios。
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