新的大豆疫霉分泌蛋白家族的生物信息学鉴定及功能分析开题报告

 2023-02-15 10:16:28

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

疫霉菌隶属于卵菌,目前已鉴定到100余种,能侵染几乎所有双子叶植物,引起多种重要作物病害[1]。

其中最著名的当属引起爱尔兰大饥荒的致病疫霉菌(Phytophthora infestans)[2]和引起大豆根腐病的大豆疫霉菌(hytophthora sojae)[3]。

大豆疫霉可造成大豆生产30%以上甚至毁灭性的损失,它可以在大豆各个发育时期发病,每年造成全球约10至20亿美元的经济损失。

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

2. 研究的基本内容和问题

目标:本研究将首先对大豆疫霉的分泌蛋白家族进行生物信息学分析,通过聚类和筛选,鉴定出功能未知的分泌蛋白家族,结合这些基因在病原菌发育和侵染过程中的基因表达谱数据,确定特定的家族,对这些基因进行克隆,通过在烟草叶片中瞬时表达这些蛋白,分析他们是否在烟草叶片上诱导植物免疫(细胞死亡)、抑制激发子诱导的植物细胞死亡,或促进疫霉菌对烟草的侵染等。

该研究以期筛选出有生物学功能的新的大豆疫霉的分泌蛋白,进一步认识效应子干扰植物抗病性的机理,明确疫霉菌致病的方式途径以及作用在寄主植物的靶标位点,可以为有效的病害防控策略提供新的思路及方向,对设计和改造抗病性有重要意义。

内容:1、通过生物信息学对病原菌的分泌蛋白组进行家族聚类与分析;2、通过基因表达谱数据推测基因的功能从而筛选候选的功能基因;3、通过蛋白的瞬时表达技术高通量筛选有功能的病原菌效应子。

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

3. 研究的方法与方案

研究方法、技术路线、实验方案利用现有的所有大豆疫霉6487的蛋白序列,通过OrthoMcl进行蛋白家族聚类,找到包含分泌蛋白的家族;在这些分泌蛋白中筛选蛋白功能未知的、基因成员在20个以上的家族,且目的蛋白可以在侵染过程中高表达。

最终确定研究的目标家族利用大豆疫霉cDNA序列和基因组序列进行基因克隆,构建植物表达载体,在烟草叶片中瞬时表达,通过注射烟草,观察是否在烟草叶片上诱导植物细胞死亡、抑制激发子诱导的植物细胞死亡,或促进疫霉菌对烟草的侵染;最后利用Western-Blot验证目的基因在烟草叶片上的蛋白表达情况。

可行性分析1、基于本实验室现有的大豆疫霉蛋白序列,利用生物信息学手段,可以很快得到目的分泌蛋白家族;2、实验室现有的对于大豆疫霉效应分子RxLR研究成果,其实验方法对本研究有所帮助。

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

4. 研究创新点

首次对于大豆疫霉蛋白中除RxLR、CRN、NLP和elicitin之外的分泌蛋白进行研究,分析其是否具有干扰植物免疫的功能。

5. 研究计划与进展

2016年9月 生物信息学分析;2016年10月2016年11月 构建载体,挑选阳性转化子;2016年12月2017年1月 注射本氏烟,统计烟草注射结果;2017年2月2017年4月试验数据整理数据及撰写论文。

剩余内容已隐藏,您需要先支付 10元 才能查看该篇文章全部内容!立即支付

以上是毕业论文开题报告,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。