1. 研究目的与意义
内容:搜集黄芪抗抑郁症的化学成分,从中药系统药理学技术平台(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/index.php)进行OB(100%)≥30和DL值≥0.18进行筛选,得到活性成分及其相关靶点。
将相关靶点的蛋白质名称导入uniprot(https://www.uniprot.org/)找出其与人类基因并进行整合去重,得到成分-靶点和蛋白质-靶点的关系。
将得到的成分-靶点和蛋白质-靶点的关系分别导入运用 Cytoscape 3.1 建立网络关系图,再将所有基因进行整合去重,将整合后的基因借助于Clue Go 等得到主要的通路。
2. 文献综述
黄芪抗抑郁症的作用机制的研究进展摘要:黄芪为中医常用的补气良药,其具有重要的药理作用。
黄芪,味甘,性微温,归肝、脾、肺、肾经,有益气固表、敛汗固脱、利水消肿的功效。
针对抑郁症的发病机制,经过多年的动物实验和临床研究,发现黄芪对抗抑郁症有明确疗效。
3. 设计方案和技术路线
以网络药理学为指导思想,采用计算机辅助分子对接技术绘制出连翘中成分-靶点-疾病的网络图,阐明成分、靶标和疾病间的关系及其主要通路。
1.搜集黄芪抗抑郁症的化学成分,从中药系统药理学技术平台(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/index.php)进行OB(100%)≥30和DL值≥0.18进行筛选,得到活性成分及其相关靶点。
2.将相关靶点的蛋白质名称导入uniprot(https://www.uniprot.org/)找出其与人类基因并进行整合去重,得到成分-靶点和蛋白质-靶点的关系。
4. 工作计划
1)2022年3月查阅相关文献,搜集相关资料,做课题的一些前期准备。
(2)2022年4月~2022年5月搜集黄芪抗抑郁症的化学成分,从中药系统药理学技术平台(TCMSP)下载化学结构和主要活性成分及其相关靶点。
成分相关靶点的蛋白质名称导入uniprot(https://www.uniprot.org/)找出其基因并进行整合去重,导入Cytoscape软件,进行化学成分-靶标相互作用网络的构建,并进一步建立成分--靶标--疾病的网络,借助于ClueGO软件等得到主要的通路。
5. 难点与创新点
1.应用网络药理学方法整合高通量组学数据分析、计算机虚拟计算、及网络数据库检索基础上的生物信息网络等多方面的技术和内容, 进行疾病-表型-基因-药物多层次网络的构建, 从整体的角度去探索药物与疾病间的关联性, 构建网络靶标,发现药物靶标, 指导新药研发。
网络药理学具有整体性、系统性、高效预测的特点。
以上是毕业论文开题报告,课题毕业论文、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。