基于网络药理学的连翘治疗肾小球肾炎潜在靶点研究开题报告

 2023-01-11 08:47:31

1. 研究目的与意义

内容:搜集连翘的化学成分,从中药系统药理学技术平台(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/index.php)进行OB(100%)≥30和DL值≥0.18进行筛选,得到活性成分及其相关靶点。

将相关靶点的蛋白质名称导入uniprot(https://www.uniprot.org/)找出其与人类基因并进行整合去重,得到成分-靶点和蛋白质-靶点的关系。

将得到的成分-靶点和蛋白质-靶点的关系分别导入运用 Cytoscape 3.1 建立网络关系图,再将所有基因进行整合去重,将整合后的基因借助于Clue Go 等得到主要的通路。

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2. 文献综述

单独附在开题报告后面

3. 设计方案和技术路线

研究方案:以网络药理学为指导思想,采用计算机辅助分子对接技术绘制出连翘中成分-靶点-疾病的网络图,阐明成分、靶标和疾病间的关系及其主要通路。

1.搜集连翘清热解毒的化学成分,从中药系统药理学技术平台(TCMSP,http://lsp.nwu.edu.cn/index.php)进行OB(100%)≥30和DL值≥0.18进行筛选,得到活性成分及其相关靶点。

2.将相关靶点的蛋白质名称导入uniprot(https://www.uniprot.org/)找出其与人类基因并进行整合去重,得到成分-靶点和蛋白质-靶点的关系。

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4. 工作计划

(1)2022年8月~2022年11月搜集连翘清热解毒的化学成分,从中药系统药理学技术平台(TCMSP)下载化学结构和主要活性成分及其相关靶点。

(2)2022年11月~2022年3月成分相关靶点的蛋白质名称导入uniprot(https://www.uniprot.org/)找出其基因并进行整合去重,导入Cytoscape软件,进行化学成分-靶标相互作用网络的构建,并进一步建立成分--靶标--疾病的网络,借助于ClueGO软件等得到主要的通路。

(3)2022年3月~2022年6月整理论文,准备答辩。

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5. 难点与创新点

1.通过网络药理学方法融合系统生物学、多向药理学、计算生物学、网络分析等多学科的技术和内容, 进行疾病-表型-基因-药物多层次网络的构建, 从整体的角度去探索药物与疾病间的关联性, 发现药物靶标, 指导新药研发。

网络药理学具有整体性、系统性的特点。

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